O Mestrado Integrado em Engenharia Informática da NOVA é, desde Julho de 2017, um curso certificado com a Marca de Qualidade EUR-ACE®.  A certificação EUR-ACE® é atribuída pela ENAEE (European Network for Accreditation of Engineering Education), após a verificação da conformidade dos cursos de engenharia do ensino superior com um conjunto de requisitos de qualidade muito exigentes, definidos por esta entidade europeia. O MIEI da FCT NOVA é o único curso de Engenharia Informática na zona de Lisboa que detêm esta importante certificação, gerida em Portugal em associação da ENAEE com a Ordem dos Engenheiros.